Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
Tmem260Q8BMD6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem260Q8BMD6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem260Q8BMD6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem260Q8BMD6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem260Q8BMD6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem260Q8BMD6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem260Q8BMD6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem260Q8BMD6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem260Q8BMD6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem260Q8BMD6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem260Q8BMD6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem260Q8BMD6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem260Q8BMD6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem260Q8BMD6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem260Q8BMD6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem260Q8BMD6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem260Q8BMD6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem260Q8BMD6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem260Q8BMD6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem260Q8BMD6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem260Q8BMD6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem260Q8BMD6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem260Q8BMD6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem260Q8BMD6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem260Q8BMD6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem260Q8BMD6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem260Q8BMD6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem260Q8BMD6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem260Q8BMD6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem260Q8BMD6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem260Q8BMD6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem260Q8BMD6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem260Q8BMD6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem260Q8BMD6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem260Q8BMD6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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