Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAR7

Ssxb10, MCG68110, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb10Q6XAR7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssxb10Q6XAR7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssxb10Q6XAR7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Ssxb10Q6XAR7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssxb10Q6XAR7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssxb10Q6XAR7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssxb10Q6XAR7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssxb10Q6XAR7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssxb10Q6XAR7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssxb10Q6XAR7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Ssxb10Q6XAR7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Ssxb10Q6XAR7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Ssxb10Q6XAR7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssxb10Q6XAR7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Ssxb10Q6XAR7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssxb10Q6XAR7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssxb10Q6XAR7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Ssxb10Q6XAR7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssxb10Q6XAR7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssxb10Q6XAR7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssxb10Q6XAR7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssxb10Q6XAR7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssxb10Q6XAR7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssxb10Q6XAR7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssxb10Q6XAR7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssxb10Q6XAR7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssxb10Q6XAR7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssxb10Q6XAR7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssxb10Q6XAR7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssxb10Q6XAR7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssxb10Q6XAR7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssxb10Q6XAR7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssxb10Q6XAR7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssxb10Q6XAR7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssxb10Q6XAR7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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