Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Knl1Q66JQ7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms