Protein–RNA interactions for Protein: Q64512

Ptpn13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn13Q64512 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
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Ptpn13Q64512 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
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Ptpn13Q64512 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
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Ptpn13Q64512 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Ptpn13Q64512 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Ptpn13Q64512 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
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Ptpn13Q64512 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Ptpn13Q64512 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Ptpn13Q64512 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Ptpn13Q64512 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Ptpn13Q64512 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn13Q64512 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Ptpn13Q64512 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms