Protein–RNA interactions for Protein: Q562D6

Trmo, tRNA (adenine(37)-N6)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmoQ562D6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrmoQ562D6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms