Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Nkx6-3Q3UHX8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Nkx6-3Q3UHX8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms