Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TchpQ3TVW5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms