Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms