Protein–RNA interactions for Protein: P97789

Xrn1, 5'-3' exoribonuclease 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn1P97789 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Xrn1P97789 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.2 ms