Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kif3aP28741 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kif3aP28741 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms