Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lama1P19137 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lama1P19137 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lama1P19137 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lama1P19137 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lama1P19137 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lama1P19137 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lama1P19137 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lama1P19137 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lama1P19137 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms