Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prf1P10820 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prf1P10820 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prf1P10820 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prf1P10820 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Prf1P10820 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prf1P10820 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prf1P10820 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prf1P10820 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prf1P10820 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prf1P10820 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prf1P10820 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prf1P10820 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prf1P10820 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prf1P10820 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prf1P10820 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms