Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms