Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trappc8E9PWG2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trappc8E9PWG2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trappc8E9PWG2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trappc8E9PWG2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trappc8E9PWG2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Trappc8E9PWG2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Trappc8E9PWG2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trappc8E9PWG2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms