Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Plod3Q9R0E1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms