Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc1Q9QZF2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.1 ms