Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp2c55Q9D816 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms