Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D2

4933402E13Rik, 4933402E13Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402E13RikQ9D4D2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933402E13RikQ9D4D2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms