Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tspan11Q9D1D1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tspan11Q9D1D1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms