Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtpbp4Q99ME9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms