Protein–RNA interactions for Protein: Q99LB7

Sardh, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SardhQ99LB7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms