Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem260Q8BMD6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem260Q8BMD6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem260Q8BMD6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem260Q8BMD6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem260Q8BMD6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem260Q8BMD6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem260Q8BMD6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem260Q8BMD6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem260Q8BMD6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem260Q8BMD6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem260Q8BMD6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem260Q8BMD6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem260Q8BMD6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem260Q8BMD6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem260Q8BMD6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem260Q8BMD6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem260Q8BMD6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem260Q8BMD6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem260Q8BMD6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem260Q8BMD6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem260Q8BMD6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem260Q8BMD6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem260Q8BMD6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem260Q8BMD6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem260Q8BMD6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem260Q8BMD6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem260Q8BMD6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem260Q8BMD6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem260Q8BMD6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem260Q8BMD6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem260Q8BMD6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem260Q8BMD6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem260Q8BMD6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem260Q8BMD6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem260Q8BMD6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem260Q8BMD6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem260Q8BMD6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem260Q8BMD6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem260Q8BMD6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem260Q8BMD6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem260Q8BMD6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem260Q8BMD6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmem260Q8BMD6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmem260Q8BMD6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmem260Q8BMD6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmem260Q8BMD6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmem260Q8BMD6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmem260Q8BMD6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmem260Q8BMD6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmem260Q8BMD6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmem260Q8BMD6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmem260Q8BMD6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmem260Q8BMD6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmem260Q8BMD6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms