Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zbtb40Q6PCS8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms