Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atg9aQ68FE2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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