Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX49

C87499, Expressed sequence C87499, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87499Q3UX49 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C87499Q3UX49 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C87499Q3UX49 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C87499Q3UX49 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C87499Q3UX49 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C87499Q3UX49 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C87499Q3UX49 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
C87499Q3UX49 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
C87499Q3UX49 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
C87499Q3UX49 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C87499Q3UX49 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms