Protein–RNA interactions for Protein: Q3UAW9

Brf2, Transcription factor IIIB 50 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf2Q3UAW9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brf2Q3UAW9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Brf2Q3UAW9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brf2Q3UAW9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brf2Q3UAW9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brf2Q3UAW9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brf2Q3UAW9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brf2Q3UAW9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brf2Q3UAW9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brf2Q3UAW9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brf2Q3UAW9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brf2Q3UAW9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brf2Q3UAW9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brf2Q3UAW9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Brf2Q3UAW9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Brf2Q3UAW9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brf2Q3UAW9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Brf2Q3UAW9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Brf2Q3UAW9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brf2Q3UAW9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brf2Q3UAW9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Brf2Q3UAW9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brf2Q3UAW9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms