Protein–RNA interactions for Protein: Q33DR2

Pdss1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdss1Q33DR2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdss1Q33DR2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdss1Q33DR2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdss1Q33DR2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdss1Q33DR2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdss1Q33DR2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdss1Q33DR2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdss1Q33DR2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdss1Q33DR2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdss1Q33DR2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdss1Q33DR2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdss1Q33DR2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdss1Q33DR2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdss1Q33DR2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdss1Q33DR2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdss1Q33DR2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdss1Q33DR2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdss1Q33DR2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdss1Q33DR2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdss1Q33DR2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdss1Q33DR2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdss1Q33DR2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdss1Q33DR2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdss1Q33DR2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdss1Q33DR2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdss1Q33DR2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdss1Q33DR2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdss1Q33DR2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.9 ms