Protein–RNA interactions for Protein: P51670

Ccl9, C-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl9P51670 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl9P51670 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms