Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41P48193 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41P48193 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Epb41P48193 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Epb41P48193 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Epb41P48193 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Epb41P48193 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms