Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kdm5cP41230 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Kdm5cP41230 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kdm5cP41230 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kdm5cP41230 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kdm5cP41230 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm5cP41230 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm5cP41230 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm5cP41230 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm5cP41230 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm5cP41230 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm5cP41230 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm5cP41230 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm5cP41230 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm5cP41230 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm5cP41230 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm5cP41230 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm5cP41230 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm5cP41230 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm5cP41230 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm5cP41230 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm5cP41230 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm5cP41230 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm5cP41230 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kdm5cP41230 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kdm5cP41230 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kdm5cP41230 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kdm5cP41230 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kdm5cP41230 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kdm5cP41230 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kdm5cP41230 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kdm5cP41230 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kdm5cP41230 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kdm5cP41230 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kdm5cP41230 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kdm5cP41230 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kdm5cP41230 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kdm5cP41230 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kdm5cP41230 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kdm5cP41230 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kdm5cP41230 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kdm5cP41230 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kdm5cP41230 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kdm5cP41230 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kdm5cP41230 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kdm5cP41230 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kdm5cP41230 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kdm5cP41230 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kdm5cP41230 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kdm5cP41230 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kdm5cP41230 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kdm5cP41230 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kdm5cP41230 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kdm5cP41230 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kdm5cP41230 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kdm5cP41230 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms