Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cnga1P29974 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms