Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lama1P19137 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lama1P19137 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lama1P19137 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lama1P19137 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lama1P19137 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lama1P19137 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lama1P19137 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lama1P19137 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lama1P19137 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lama1P19137 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lama1P19137 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.4 ms