Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RhoP15409 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RhoP15409 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RhoP15409 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RhoP15409 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RhoP15409 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RhoP15409 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RhoP15409 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RhoP15409 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RhoP15409 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RhoP15409 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RhoP15409 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RhoP15409 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RhoP15409 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RhoP15409 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RhoP15409 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RhoP15409 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RhoP15409 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RhoP15409 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RhoP15409 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RhoP15409 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RhoP15409 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RhoP15409 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RhoP15409 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RhoP15409 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RhoP15409 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RhoP15409 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RhoP15409 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RhoP15409 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RhoP15409 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RhoP15409 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RhoP15409 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RhoP15409 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RhoP15409 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RhoP15409 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RhoP15409 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RhoP15409 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RhoP15409 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RhoP15409 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RhoP15409 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RhoP15409 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RhoP15409 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RhoP15409 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RhoP15409 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RhoP15409 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RhoP15409 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RhoP15409 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RhoP15409 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RhoP15409 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RhoP15409 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RhoP15409 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RhoP15409 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RhoP15409 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RhoP15409 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RhoP15409 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RhoP15409 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RhoP15409 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RhoP15409 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RhoP15409 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RhoP15409 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RhoP15409 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RhoP15409 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RhoP15409 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RhoP15409 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RhoP15409 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RhoP15409 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RhoP15409 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RhoP15409 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RhoP15409 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RhoP15409 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RhoP15409 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RhoP15409 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RhoP15409 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RhoP15409 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RhoP15409 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RhoP15409 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RhoP15409 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RhoP15409 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RhoP15409 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RhoP15409 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RhoP15409 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RhoP15409 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RhoP15409 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RhoP15409 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RhoP15409 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RhoP15409 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RhoP15409 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RhoP15409 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RhoP15409 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RhoP15409 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RhoP15409 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RhoP15409 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RhoP15409 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RhoP15409 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RhoP15409 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RhoP15409 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RhoP15409 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RhoP15409 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RhoP15409 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RhoP15409 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms