Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BckdkO55028 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BckdkO55028 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BckdkO55028 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BckdkO55028 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BckdkO55028 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms