Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
E2f6O54917 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2f6O54917 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2f6O54917 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2f6O54917 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2f6O54917 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2f6O54917 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2f6O54917 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2f6O54917 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
E2f6O54917 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
E2f6O54917 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
E2f6O54917 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
E2f6O54917 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
E2f6O54917 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
E2f6O54917 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
E2f6O54917 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2f6O54917 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2f6O54917 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2f6O54917 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2f6O54917 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2f6O54917 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2f6O54917 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms