Protein–RNA interactions for Protein: O35551

Rabep1, Rab GTPase-binding effector protein 1, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabep1O35551 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms