Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Speer4aF8VPX6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Speer4aF8VPX6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Speer4aF8VPX6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Speer4aF8VPX6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Speer4aF8VPX6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Speer4aF8VPX6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Speer4aF8VPX6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Speer4aF8VPX6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Speer4aF8VPX6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Speer4aF8VPX6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Speer4aF8VPX6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Speer4aF8VPX6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Speer4aF8VPX6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Speer4aF8VPX6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Speer4aF8VPX6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Speer4aF8VPX6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Speer4aF8VPX6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Speer4aF8VPX6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Speer4aF8VPX6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Speer4aF8VPX6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Speer4aF8VPX6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Speer4aF8VPX6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Speer4aF8VPX6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Speer4aF8VPX6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Speer4aF8VPX6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Speer4aF8VPX6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Speer4aF8VPX6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Speer4aF8VPX6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Speer4aF8VPX6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Speer4aF8VPX6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Speer4aF8VPX6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Speer4aF8VPX6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Speer4aF8VPX6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Speer4aF8VPX6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Speer4aF8VPX6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Speer4aF8VPX6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Speer4aF8VPX6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Speer4aF8VPX6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Speer4aF8VPX6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Speer4aF8VPX6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Speer4aF8VPX6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms