Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20425E9Q035 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms