Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brpf1B2RRD7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms