Protein–RNA interactions for Protein: S4R1W5

Rbm6, RNA-binding motif protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm6S4R1W5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rbm6S4R1W5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rbm6S4R1W5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rbm6S4R1W5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rbm6S4R1W5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rbm6S4R1W5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rbm6S4R1W5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rbm6S4R1W5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rbm6S4R1W5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rbm6S4R1W5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rbm6S4R1W5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rbm6S4R1W5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rbm6S4R1W5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rbm6S4R1W5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rbm6S4R1W5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rbm6S4R1W5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rbm6S4R1W5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rbm6S4R1W5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rbm6S4R1W5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rbm6S4R1W5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rbm6S4R1W5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rbm6S4R1W5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rbm6S4R1W5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rbm6S4R1W5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rbm6S4R1W5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rbm6S4R1W5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rbm6S4R1W5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rbm6S4R1W5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rbm6S4R1W5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rbm6S4R1W5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rbm6S4R1W5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Rbm6S4R1W5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Rbm6S4R1W5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rbm6S4R1W5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rbm6S4R1W5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Rbm6S4R1W5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rbm6S4R1W5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rbm6S4R1W5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Rbm6S4R1W5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rbm6S4R1W5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rbm6S4R1W5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rbm6S4R1W5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rbm6S4R1W5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rbm6S4R1W5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rbm6S4R1W5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rbm6S4R1W5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rbm6S4R1W5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rbm6S4R1W5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rbm6S4R1W5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rbm6S4R1W5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rbm6S4R1W5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Rbm6S4R1W5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rbm6S4R1W5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rbm6S4R1W5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rbm6S4R1W5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rbm6S4R1W5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rbm6S4R1W5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rbm6S4R1W5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rbm6S4R1W5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rbm6S4R1W5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rbm6S4R1W5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rbm6S4R1W5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rbm6S4R1W5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rbm6S4R1W5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rbm6S4R1W5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rbm6S4R1W5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rbm6S4R1W5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rbm6S4R1W5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rbm6S4R1W5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rbm6S4R1W5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rbm6S4R1W5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rbm6S4R1W5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rbm6S4R1W5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rbm6S4R1W5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rbm6S4R1W5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rbm6S4R1W5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rbm6S4R1W5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rbm6S4R1W5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Rbm6S4R1W5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Rbm6S4R1W5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rbm6S4R1W5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rbm6S4R1W5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rbm6S4R1W5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rbm6S4R1W5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rbm6S4R1W5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Rbm6S4R1W5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rbm6S4R1W5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rbm6S4R1W5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Rbm6S4R1W5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rbm6S4R1W5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Rbm6S4R1W5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rbm6S4R1W5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rbm6S4R1W5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rbm6S4R1W5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rbm6S4R1W5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rbm6S4R1W5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rbm6S4R1W5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rbm6S4R1W5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rbm6S4R1W5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rbm6S4R1W5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90 ms