Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Krt27Q9Z320 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krt27Q9Z320 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krt27Q9Z320 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krt27Q9Z320 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Krt27Q9Z320 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Krt27Q9Z320 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Krt27Q9Z320 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Krt27Q9Z320 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Krt27Q9Z320 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Krt27Q9Z320 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Krt27Q9Z320 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Krt27Q9Z320 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Krt27Q9Z320 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Krt27Q9Z320 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Krt27Q9Z320 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Krt27Q9Z320 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Krt27Q9Z320 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Krt27Q9Z320 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Krt27Q9Z320 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Krt27Q9Z320 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Krt27Q9Z320 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Krt27Q9Z320 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Krt27Q9Z320 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Krt27Q9Z320 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Krt27Q9Z320 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Krt27Q9Z320 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Krt27Q9Z320 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Krt27Q9Z320 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Krt27Q9Z320 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Krt27Q9Z320 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Krt27Q9Z320 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Krt27Q9Z320 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Krt27Q9Z320 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Krt27Q9Z320 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt27Q9Z320 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt27Q9Z320 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Krt27Q9Z320 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt27Q9Z320 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Krt27Q9Z320 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Krt27Q9Z320 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt27Q9Z320 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt27Q9Z320 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt27Q9Z320 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt27Q9Z320 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt27Q9Z320 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krt27Q9Z320 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Krt27Q9Z320 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Krt27Q9Z320 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Krt27Q9Z320 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt27Q9Z320 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt27Q9Z320 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt27Q9Z320 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt27Q9Z320 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt27Q9Z320 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt27Q9Z320 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt27Q9Z320 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt27Q9Z320 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt27Q9Z320 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt27Q9Z320 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt27Q9Z320 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt27Q9Z320 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Krt27Q9Z320 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Krt27Q9Z320 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Krt27Q9Z320 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Krt27Q9Z320 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt27Q9Z320 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Krt27Q9Z320 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Krt27Q9Z320 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt27Q9Z320 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt27Q9Z320 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt27Q9Z320 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt27Q9Z320 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt27Q9Z320 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt27Q9Z320 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt27Q9Z320 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt27Q9Z320 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt27Q9Z320 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt27Q9Z320 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt27Q9Z320 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krt27Q9Z320 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt27Q9Z320 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt27Q9Z320 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt27Q9Z320 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Krt27Q9Z320 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Krt27Q9Z320 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Krt27Q9Z320 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt27Q9Z320 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt27Q9Z320 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt27Q9Z320 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt27Q9Z320 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt27Q9Z320 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt27Q9Z320 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt27Q9Z320 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt27Q9Z320 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt27Q9Z320 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt27Q9Z320 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt27Q9Z320 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt27Q9Z320 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt27Q9Z320 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms