Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Uso1Q9Z1Z0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Uso1Q9Z1Z0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Uso1Q9Z1Z0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Uso1Q9Z1Z0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Uso1Q9Z1Z0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Uso1Q9Z1Z0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Uso1Q9Z1Z0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Uso1Q9Z1Z0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Uso1Q9Z1Z0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Uso1Q9Z1Z0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Uso1Q9Z1Z0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Uso1Q9Z1Z0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Uso1Q9Z1Z0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Uso1Q9Z1Z0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Uso1Q9Z1Z0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Uso1Q9Z1Z0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Uso1Q9Z1Z0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Uso1Q9Z1Z0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Uso1Q9Z1Z0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Uso1Q9Z1Z0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Uso1Q9Z1Z0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Uso1Q9Z1Z0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Uso1Q9Z1Z0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Uso1Q9Z1Z0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Uso1Q9Z1Z0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Uso1Q9Z1Z0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Uso1Q9Z1Z0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Uso1Q9Z1Z0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Uso1Q9Z1Z0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Uso1Q9Z1Z0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Uso1Q9Z1Z0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Uso1Q9Z1Z0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Uso1Q9Z1Z0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Uso1Q9Z1Z0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Uso1Q9Z1Z0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Uso1Q9Z1Z0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Uso1Q9Z1Z0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Uso1Q9Z1Z0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Uso1Q9Z1Z0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Uso1Q9Z1Z0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Uso1Q9Z1Z0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Uso1Q9Z1Z0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Uso1Q9Z1Z0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Uso1Q9Z1Z0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Uso1Q9Z1Z0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Uso1Q9Z1Z0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Uso1Q9Z1Z0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Uso1Q9Z1Z0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Uso1Q9Z1Z0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Uso1Q9Z1Z0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Uso1Q9Z1Z0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Uso1Q9Z1Z0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Uso1Q9Z1Z0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Uso1Q9Z1Z0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Uso1Q9Z1Z0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Uso1Q9Z1Z0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Uso1Q9Z1Z0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Uso1Q9Z1Z0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Uso1Q9Z1Z0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Uso1Q9Z1Z0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Uso1Q9Z1Z0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Uso1Q9Z1Z0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Uso1Q9Z1Z0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Uso1Q9Z1Z0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Uso1Q9Z1Z0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Uso1Q9Z1Z0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Uso1Q9Z1Z0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Uso1Q9Z1Z0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Uso1Q9Z1Z0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Uso1Q9Z1Z0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Uso1Q9Z1Z0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Uso1Q9Z1Z0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Uso1Q9Z1Z0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Uso1Q9Z1Z0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Uso1Q9Z1Z0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Uso1Q9Z1Z0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Uso1Q9Z1Z0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Uso1Q9Z1Z0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Uso1Q9Z1Z0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Uso1Q9Z1Z0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Uso1Q9Z1Z0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Uso1Q9Z1Z0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Uso1Q9Z1Z0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Uso1Q9Z1Z0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Uso1Q9Z1Z0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Uso1Q9Z1Z0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Uso1Q9Z1Z0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Uso1Q9Z1Z0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Uso1Q9Z1Z0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Uso1Q9Z1Z0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Uso1Q9Z1Z0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Uso1Q9Z1Z0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Uso1Q9Z1Z0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Uso1Q9Z1Z0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Uso1Q9Z1Z0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Uso1Q9Z1Z0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Uso1Q9Z1Z0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Uso1Q9Z1Z0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Uso1Q9Z1Z0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1149.4 ms