Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Shcbp1Q9Z179 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Shcbp1Q9Z179 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Shcbp1Q9Z179 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Shcbp1Q9Z179 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Shcbp1Q9Z179 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Shcbp1Q9Z179 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Shcbp1Q9Z179 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Shcbp1Q9Z179 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Shcbp1Q9Z179 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Shcbp1Q9Z179 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Shcbp1Q9Z179 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Shcbp1Q9Z179 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Shcbp1Q9Z179 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Shcbp1Q9Z179 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Shcbp1Q9Z179 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Shcbp1Q9Z179 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Shcbp1Q9Z179 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Shcbp1Q9Z179 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Shcbp1Q9Z179 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Shcbp1Q9Z179 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Shcbp1Q9Z179 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Shcbp1Q9Z179 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Shcbp1Q9Z179 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Shcbp1Q9Z179 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Shcbp1Q9Z179 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Shcbp1Q9Z179 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Shcbp1Q9Z179 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Shcbp1Q9Z179 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Shcbp1Q9Z179 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Shcbp1Q9Z179 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Shcbp1Q9Z179 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Shcbp1Q9Z179 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Shcbp1Q9Z179 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Shcbp1Q9Z179 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Shcbp1Q9Z179 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Shcbp1Q9Z179 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24■■□□□ 1.43
Shcbp1Q9Z179 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Shcbp1Q9Z179 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Shcbp1Q9Z179 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Shcbp1Q9Z179 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Shcbp1Q9Z179 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Shcbp1Q9Z179 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Shcbp1Q9Z179 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Shcbp1Q9Z179 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Shcbp1Q9Z179 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Shcbp1Q9Z179 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Shcbp1Q9Z179 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Shcbp1Q9Z179 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Shcbp1Q9Z179 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Shcbp1Q9Z179 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Shcbp1Q9Z179 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Shcbp1Q9Z179 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Shcbp1Q9Z179 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Shcbp1Q9Z179 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Shcbp1Q9Z179 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shcbp1Q9Z179 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shcbp1Q9Z179 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shcbp1Q9Z179 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Shcbp1Q9Z179 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Shcbp1Q9Z179 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Shcbp1Q9Z179 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Shcbp1Q9Z179 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Shcbp1Q9Z179 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Shcbp1Q9Z179 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Shcbp1Q9Z179 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Shcbp1Q9Z179 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Shcbp1Q9Z179 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Shcbp1Q9Z179 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Shcbp1Q9Z179 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Shcbp1Q9Z179 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Shcbp1Q9Z179 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Shcbp1Q9Z179 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Shcbp1Q9Z179 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Shcbp1Q9Z179 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Shcbp1Q9Z179 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Shcbp1Q9Z179 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Shcbp1Q9Z179 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Shcbp1Q9Z179 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Shcbp1Q9Z179 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Shcbp1Q9Z179 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Shcbp1Q9Z179 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Shcbp1Q9Z179 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Shcbp1Q9Z179 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Shcbp1Q9Z179 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Shcbp1Q9Z179 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Shcbp1Q9Z179 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Shcbp1Q9Z179 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Shcbp1Q9Z179 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Shcbp1Q9Z179 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Shcbp1Q9Z179 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Shcbp1Q9Z179 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Shcbp1Q9Z179 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Shcbp1Q9Z179 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Shcbp1Q9Z179 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Shcbp1Q9Z179 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Shcbp1Q9Z179 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Shcbp1Q9Z179 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Shcbp1Q9Z179 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Shcbp1Q9Z179 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms