Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cog1Q9Z160 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cog1Q9Z160 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cog1Q9Z160 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cog1Q9Z160 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Cog1Q9Z160 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cog1Q9Z160 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cog1Q9Z160 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cog1Q9Z160 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cog1Q9Z160 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cog1Q9Z160 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cog1Q9Z160 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cog1Q9Z160 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cog1Q9Z160 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cog1Q9Z160 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cog1Q9Z160 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cog1Q9Z160 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cog1Q9Z160 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cog1Q9Z160 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cog1Q9Z160 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cog1Q9Z160 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cog1Q9Z160 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cog1Q9Z160 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cog1Q9Z160 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cog1Q9Z160 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cog1Q9Z160 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cog1Q9Z160 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cog1Q9Z160 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cog1Q9Z160 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cog1Q9Z160 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cog1Q9Z160 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cog1Q9Z160 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cog1Q9Z160 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cog1Q9Z160 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cog1Q9Z160 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cog1Q9Z160 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cog1Q9Z160 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cog1Q9Z160 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Cog1Q9Z160 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Cog1Q9Z160 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cog1Q9Z160 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cog1Q9Z160 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cog1Q9Z160 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cog1Q9Z160 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cog1Q9Z160 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cog1Q9Z160 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cog1Q9Z160 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cog1Q9Z160 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cog1Q9Z160 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cog1Q9Z160 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cog1Q9Z160 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cog1Q9Z160 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cog1Q9Z160 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cog1Q9Z160 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cog1Q9Z160 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cog1Q9Z160 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cog1Q9Z160 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cog1Q9Z160 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cog1Q9Z160 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cog1Q9Z160 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cog1Q9Z160 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cog1Q9Z160 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cog1Q9Z160 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cog1Q9Z160 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cog1Q9Z160 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cog1Q9Z160 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cog1Q9Z160 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cog1Q9Z160 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cog1Q9Z160 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cog1Q9Z160 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cog1Q9Z160 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cog1Q9Z160 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cog1Q9Z160 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cog1Q9Z160 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cog1Q9Z160 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cog1Q9Z160 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cog1Q9Z160 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cog1Q9Z160 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cog1Q9Z160 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cog1Q9Z160 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cog1Q9Z160 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cog1Q9Z160 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cog1Q9Z160 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cog1Q9Z160 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cog1Q9Z160 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cog1Q9Z160 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cog1Q9Z160 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cog1Q9Z160 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cog1Q9Z160 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cog1Q9Z160 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cog1Q9Z160 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cog1Q9Z160 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cog1Q9Z160 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cog1Q9Z160 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cog1Q9Z160 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cog1Q9Z160 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cog1Q9Z160 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cog1Q9Z160 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cog1Q9Z160 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cog1Q9Z160 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms