Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVG6

Carm1, Histone-arginine methyltransferase CARM1, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carm1Q9WVG6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Carm1Q9WVG6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Carm1Q9WVG6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Carm1Q9WVG6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Carm1Q9WVG6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Carm1Q9WVG6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Carm1Q9WVG6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Carm1Q9WVG6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Carm1Q9WVG6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Carm1Q9WVG6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Carm1Q9WVG6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Carm1Q9WVG6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Carm1Q9WVG6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Carm1Q9WVG6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Carm1Q9WVG6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Carm1Q9WVG6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Carm1Q9WVG6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Carm1Q9WVG6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Carm1Q9WVG6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Carm1Q9WVG6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Carm1Q9WVG6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Carm1Q9WVG6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Carm1Q9WVG6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Carm1Q9WVG6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Carm1Q9WVG6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Carm1Q9WVG6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Carm1Q9WVG6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Carm1Q9WVG6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Carm1Q9WVG6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Carm1Q9WVG6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Carm1Q9WVG6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Carm1Q9WVG6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Carm1Q9WVG6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Carm1Q9WVG6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Carm1Q9WVG6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Carm1Q9WVG6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Carm1Q9WVG6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Carm1Q9WVG6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Carm1Q9WVG6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Carm1Q9WVG6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Carm1Q9WVG6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Carm1Q9WVG6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Carm1Q9WVG6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Carm1Q9WVG6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Carm1Q9WVG6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Carm1Q9WVG6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Carm1Q9WVG6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Carm1Q9WVG6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Carm1Q9WVG6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Carm1Q9WVG6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Carm1Q9WVG6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Carm1Q9WVG6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Carm1Q9WVG6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Carm1Q9WVG6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Carm1Q9WVG6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Carm1Q9WVG6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Carm1Q9WVG6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Carm1Q9WVG6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Carm1Q9WVG6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Carm1Q9WVG6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Carm1Q9WVG6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Carm1Q9WVG6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Carm1Q9WVG6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Carm1Q9WVG6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Carm1Q9WVG6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Carm1Q9WVG6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Carm1Q9WVG6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Carm1Q9WVG6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Carm1Q9WVG6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Carm1Q9WVG6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Carm1Q9WVG6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Carm1Q9WVG6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Carm1Q9WVG6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Carm1Q9WVG6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Carm1Q9WVG6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Carm1Q9WVG6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Carm1Q9WVG6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Carm1Q9WVG6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Carm1Q9WVG6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Carm1Q9WVG6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Carm1Q9WVG6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Carm1Q9WVG6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Carm1Q9WVG6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Carm1Q9WVG6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Carm1Q9WVG6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Carm1Q9WVG6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Carm1Q9WVG6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Carm1Q9WVG6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Carm1Q9WVG6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Carm1Q9WVG6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Carm1Q9WVG6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Carm1Q9WVG6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Carm1Q9WVG6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Carm1Q9WVG6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Carm1Q9WVG6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Carm1Q9WVG6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Carm1Q9WVG6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Carm1Q9WVG6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Carm1Q9WVG6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Carm1Q9WVG6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms