Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVF7

Pole, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 2,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PoleQ9WVF7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PoleQ9WVF7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PoleQ9WVF7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PoleQ9WVF7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PoleQ9WVF7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PoleQ9WVF7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PoleQ9WVF7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PoleQ9WVF7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PoleQ9WVF7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PoleQ9WVF7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PoleQ9WVF7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PoleQ9WVF7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PoleQ9WVF7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PoleQ9WVF7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PoleQ9WVF7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PoleQ9WVF7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PoleQ9WVF7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PoleQ9WVF7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PoleQ9WVF7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PoleQ9WVF7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PoleQ9WVF7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PoleQ9WVF7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PoleQ9WVF7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PoleQ9WVF7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PoleQ9WVF7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PoleQ9WVF7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PoleQ9WVF7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PoleQ9WVF7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PoleQ9WVF7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PoleQ9WVF7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PoleQ9WVF7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PoleQ9WVF7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PoleQ9WVF7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PoleQ9WVF7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PoleQ9WVF7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PoleQ9WVF7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PoleQ9WVF7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PoleQ9WVF7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PoleQ9WVF7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PoleQ9WVF7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PoleQ9WVF7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PoleQ9WVF7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PoleQ9WVF7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PoleQ9WVF7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PoleQ9WVF7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PoleQ9WVF7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PoleQ9WVF7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PoleQ9WVF7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PoleQ9WVF7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PoleQ9WVF7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PoleQ9WVF7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PoleQ9WVF7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PoleQ9WVF7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PoleQ9WVF7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PoleQ9WVF7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PoleQ9WVF7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PoleQ9WVF7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PoleQ9WVF7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PoleQ9WVF7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PoleQ9WVF7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PoleQ9WVF7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PoleQ9WVF7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PoleQ9WVF7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PoleQ9WVF7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PoleQ9WVF7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PoleQ9WVF7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PoleQ9WVF7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PoleQ9WVF7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PoleQ9WVF7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PoleQ9WVF7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PoleQ9WVF7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PoleQ9WVF7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PoleQ9WVF7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PoleQ9WVF7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PoleQ9WVF7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PoleQ9WVF7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PoleQ9WVF7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PoleQ9WVF7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PoleQ9WVF7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PoleQ9WVF7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PoleQ9WVF7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PoleQ9WVF7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PoleQ9WVF7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PoleQ9WVF7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PoleQ9WVF7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PoleQ9WVF7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PoleQ9WVF7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PoleQ9WVF7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PoleQ9WVF7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PoleQ9WVF7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PoleQ9WVF7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PoleQ9WVF7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PoleQ9WVF7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PoleQ9WVF7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PoleQ9WVF7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PoleQ9WVF7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PoleQ9WVF7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PoleQ9WVF7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PoleQ9WVF7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PoleQ9WVF7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms