Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU62

Incenp, Inner centromere protein, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IncenpQ9WU62 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
IncenpQ9WU62 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
IncenpQ9WU62 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
IncenpQ9WU62 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
IncenpQ9WU62 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
IncenpQ9WU62 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
IncenpQ9WU62 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
IncenpQ9WU62 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
IncenpQ9WU62 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
IncenpQ9WU62 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
IncenpQ9WU62 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
IncenpQ9WU62 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
IncenpQ9WU62 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
IncenpQ9WU62 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
IncenpQ9WU62 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
IncenpQ9WU62 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
IncenpQ9WU62 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
IncenpQ9WU62 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
IncenpQ9WU62 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
IncenpQ9WU62 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
IncenpQ9WU62 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
IncenpQ9WU62 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
IncenpQ9WU62 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
IncenpQ9WU62 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
IncenpQ9WU62 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
IncenpQ9WU62 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
IncenpQ9WU62 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
IncenpQ9WU62 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
IncenpQ9WU62 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
IncenpQ9WU62 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
IncenpQ9WU62 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.57
IncenpQ9WU62 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
IncenpQ9WU62 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
IncenpQ9WU62 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
IncenpQ9WU62 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
IncenpQ9WU62 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
IncenpQ9WU62 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
IncenpQ9WU62 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
IncenpQ9WU62 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
IncenpQ9WU62 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
IncenpQ9WU62 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
IncenpQ9WU62 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
IncenpQ9WU62 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
IncenpQ9WU62 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
IncenpQ9WU62 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
IncenpQ9WU62 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
IncenpQ9WU62 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
IncenpQ9WU62 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
IncenpQ9WU62 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
IncenpQ9WU62 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
IncenpQ9WU62 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
IncenpQ9WU62 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
IncenpQ9WU62 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
IncenpQ9WU62 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
IncenpQ9WU62 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
IncenpQ9WU62 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
IncenpQ9WU62 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
IncenpQ9WU62 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
IncenpQ9WU62 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
IncenpQ9WU62 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
IncenpQ9WU62 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
IncenpQ9WU62 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
IncenpQ9WU62 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
IncenpQ9WU62 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
IncenpQ9WU62 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
IncenpQ9WU62 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
IncenpQ9WU62 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
IncenpQ9WU62 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
IncenpQ9WU62 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
IncenpQ9WU62 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
IncenpQ9WU62 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
IncenpQ9WU62 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
IncenpQ9WU62 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
IncenpQ9WU62 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
IncenpQ9WU62 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
IncenpQ9WU62 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
IncenpQ9WU62 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
IncenpQ9WU62 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
IncenpQ9WU62 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
IncenpQ9WU62 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
IncenpQ9WU62 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
IncenpQ9WU62 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
IncenpQ9WU62 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
IncenpQ9WU62 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
IncenpQ9WU62 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
IncenpQ9WU62 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
IncenpQ9WU62 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
IncenpQ9WU62 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
IncenpQ9WU62 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
IncenpQ9WU62 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
IncenpQ9WU62 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
IncenpQ9WU62 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
IncenpQ9WU62 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
IncenpQ9WU62 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
IncenpQ9WU62 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
IncenpQ9WU62 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
IncenpQ9WU62 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
IncenpQ9WU62 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
IncenpQ9WU62 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
IncenpQ9WU62 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms