Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR6

Slc7a11, Cystine/glutamate transporter, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a11Q9WTR6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc7a11Q9WTR6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc7a11Q9WTR6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc7a11Q9WTR6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc7a11Q9WTR6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc7a11Q9WTR6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc7a11Q9WTR6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc7a11Q9WTR6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc7a11Q9WTR6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc7a11Q9WTR6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc7a11Q9WTR6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc7a11Q9WTR6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc7a11Q9WTR6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc7a11Q9WTR6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc7a11Q9WTR6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc7a11Q9WTR6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc7a11Q9WTR6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc7a11Q9WTR6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc7a11Q9WTR6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc7a11Q9WTR6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc7a11Q9WTR6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc7a11Q9WTR6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc7a11Q9WTR6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc7a11Q9WTR6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc7a11Q9WTR6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc7a11Q9WTR6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc7a11Q9WTR6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc7a11Q9WTR6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc7a11Q9WTR6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc7a11Q9WTR6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc7a11Q9WTR6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc7a11Q9WTR6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc7a11Q9WTR6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc7a11Q9WTR6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc7a11Q9WTR6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc7a11Q9WTR6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc7a11Q9WTR6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc7a11Q9WTR6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc7a11Q9WTR6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc7a11Q9WTR6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc7a11Q9WTR6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc7a11Q9WTR6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc7a11Q9WTR6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc7a11Q9WTR6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc7a11Q9WTR6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc7a11Q9WTR6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc7a11Q9WTR6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc7a11Q9WTR6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc7a11Q9WTR6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc7a11Q9WTR6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc7a11Q9WTR6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc7a11Q9WTR6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc7a11Q9WTR6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc7a11Q9WTR6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc7a11Q9WTR6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc7a11Q9WTR6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc7a11Q9WTR6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc7a11Q9WTR6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc7a11Q9WTR6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc7a11Q9WTR6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc7a11Q9WTR6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc7a11Q9WTR6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc7a11Q9WTR6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc7a11Q9WTR6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc7a11Q9WTR6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc7a11Q9WTR6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc7a11Q9WTR6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc7a11Q9WTR6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc7a11Q9WTR6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc7a11Q9WTR6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc7a11Q9WTR6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc7a11Q9WTR6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc7a11Q9WTR6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc7a11Q9WTR6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc7a11Q9WTR6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc7a11Q9WTR6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc7a11Q9WTR6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc7a11Q9WTR6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc7a11Q9WTR6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc7a11Q9WTR6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc7a11Q9WTR6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc7a11Q9WTR6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc7a11Q9WTR6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc7a11Q9WTR6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc7a11Q9WTR6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc7a11Q9WTR6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc7a11Q9WTR6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc7a11Q9WTR6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc7a11Q9WTR6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc7a11Q9WTR6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc7a11Q9WTR6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc7a11Q9WTR6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc7a11Q9WTR6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc7a11Q9WTR6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc7a11Q9WTR6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc7a11Q9WTR6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc7a11Q9WTR6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc7a11Q9WTR6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc7a11Q9WTR6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc7a11Q9WTR6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms