Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psma4Q9R1P0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Psma4Q9R1P0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psma4Q9R1P0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psma4Q9R1P0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psma4Q9R1P0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psma4Q9R1P0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Psma4Q9R1P0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psma4Q9R1P0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psma4Q9R1P0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psma4Q9R1P0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psma4Q9R1P0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psma4Q9R1P0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psma4Q9R1P0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psma4Q9R1P0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psma4Q9R1P0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Psma4Q9R1P0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psma4Q9R1P0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psma4Q9R1P0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psma4Q9R1P0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psma4Q9R1P0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psma4Q9R1P0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psma4Q9R1P0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psma4Q9R1P0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psma4Q9R1P0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psma4Q9R1P0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psma4Q9R1P0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psma4Q9R1P0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Psma4Q9R1P0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Psma4Q9R1P0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psma4Q9R1P0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psma4Q9R1P0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psma4Q9R1P0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psma4Q9R1P0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psma4Q9R1P0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psma4Q9R1P0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psma4Q9R1P0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psma4Q9R1P0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psma4Q9R1P0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psma4Q9R1P0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psma4Q9R1P0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psma4Q9R1P0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psma4Q9R1P0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psma4Q9R1P0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psma4Q9R1P0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psma4Q9R1P0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psma4Q9R1P0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psma4Q9R1P0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psma4Q9R1P0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psma4Q9R1P0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psma4Q9R1P0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psma4Q9R1P0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psma4Q9R1P0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psma4Q9R1P0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psma4Q9R1P0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psma4Q9R1P0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psma4Q9R1P0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Psma4Q9R1P0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psma4Q9R1P0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psma4Q9R1P0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psma4Q9R1P0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psma4Q9R1P0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psma4Q9R1P0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psma4Q9R1P0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psma4Q9R1P0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psma4Q9R1P0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psma4Q9R1P0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Psma4Q9R1P0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psma4Q9R1P0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psma4Q9R1P0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psma4Q9R1P0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psma4Q9R1P0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Psma4Q9R1P0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psma4Q9R1P0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psma4Q9R1P0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psma4Q9R1P0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psma4Q9R1P0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psma4Q9R1P0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Psma4Q9R1P0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psma4Q9R1P0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psma4Q9R1P0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psma4Q9R1P0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psma4Q9R1P0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psma4Q9R1P0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psma4Q9R1P0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Psma4Q9R1P0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psma4Q9R1P0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psma4Q9R1P0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psma4Q9R1P0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psma4Q9R1P0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Psma4Q9R1P0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Psma4Q9R1P0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Psma4Q9R1P0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Psma4Q9R1P0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Psma4Q9R1P0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Psma4Q9R1P0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Psma4Q9R1P0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psma4Q9R1P0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psma4Q9R1P0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psma4Q9R1P0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms