Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q8

Clec4e, C-type lectin domain family 4 member E, mousemouse

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4eQ9R0Q8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clec4eQ9R0Q8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clec4eQ9R0Q8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clec4eQ9R0Q8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clec4eQ9R0Q8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clec4eQ9R0Q8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Clec4eQ9R0Q8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clec4eQ9R0Q8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Clec4eQ9R0Q8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clec4eQ9R0Q8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clec4eQ9R0Q8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clec4eQ9R0Q8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clec4eQ9R0Q8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clec4eQ9R0Q8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clec4eQ9R0Q8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clec4eQ9R0Q8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clec4eQ9R0Q8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clec4eQ9R0Q8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Clec4eQ9R0Q8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clec4eQ9R0Q8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Clec4eQ9R0Q8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clec4eQ9R0Q8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clec4eQ9R0Q8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clec4eQ9R0Q8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clec4eQ9R0Q8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clec4eQ9R0Q8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clec4eQ9R0Q8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clec4eQ9R0Q8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clec4eQ9R0Q8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clec4eQ9R0Q8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clec4eQ9R0Q8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clec4eQ9R0Q8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clec4eQ9R0Q8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clec4eQ9R0Q8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clec4eQ9R0Q8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clec4eQ9R0Q8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clec4eQ9R0Q8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clec4eQ9R0Q8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clec4eQ9R0Q8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clec4eQ9R0Q8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clec4eQ9R0Q8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clec4eQ9R0Q8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clec4eQ9R0Q8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clec4eQ9R0Q8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clec4eQ9R0Q8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clec4eQ9R0Q8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Clec4eQ9R0Q8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Clec4eQ9R0Q8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clec4eQ9R0Q8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clec4eQ9R0Q8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clec4eQ9R0Q8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clec4eQ9R0Q8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clec4eQ9R0Q8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clec4eQ9R0Q8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Clec4eQ9R0Q8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clec4eQ9R0Q8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clec4eQ9R0Q8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clec4eQ9R0Q8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Clec4eQ9R0Q8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clec4eQ9R0Q8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clec4eQ9R0Q8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clec4eQ9R0Q8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Clec4eQ9R0Q8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clec4eQ9R0Q8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Clec4eQ9R0Q8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clec4eQ9R0Q8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Clec4eQ9R0Q8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clec4eQ9R0Q8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clec4eQ9R0Q8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clec4eQ9R0Q8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clec4eQ9R0Q8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Clec4eQ9R0Q8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clec4eQ9R0Q8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clec4eQ9R0Q8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clec4eQ9R0Q8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clec4eQ9R0Q8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Clec4eQ9R0Q8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clec4eQ9R0Q8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Clec4eQ9R0Q8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clec4eQ9R0Q8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Clec4eQ9R0Q8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Clec4eQ9R0Q8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clec4eQ9R0Q8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clec4eQ9R0Q8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Clec4eQ9R0Q8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clec4eQ9R0Q8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Clec4eQ9R0Q8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Clec4eQ9R0Q8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clec4eQ9R0Q8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clec4eQ9R0Q8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clec4eQ9R0Q8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Clec4eQ9R0Q8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Clec4eQ9R0Q8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clec4eQ9R0Q8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clec4eQ9R0Q8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clec4eQ9R0Q8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clec4eQ9R0Q8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clec4eQ9R0Q8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clec4eQ9R0Q8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clec4eQ9R0Q8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
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